深圳市财政局在向市四届人大常委会第十三次会议提请审议的深圳市2006年社会保险基金决算和2007年1－6月社会保险基金预算执行情况的报告中表示，将重点改革医疗保险办法，适当提高参保人员待遇水平，从而使医疗保险对市民健康的保障作用进一步得到发挥。

　　根据报告，2006年深圳市各项社会保险基金总收入182.08亿元，支出76.82亿元，年度结余105.26亿元，历年累计结余462.04亿元。其中基本养老保险基金收入129.22亿元，支出53.84亿元，累计结余332.31亿元。基本医疗保险基金收入35.95亿元，支出14.72亿元，累计结余86.85亿元。

　　今年上半年，这个数字继续增长，各项社会保险基金实现总收入111.62亿元，支出38亿元，结余73.72亿元，累计结余535.66亿元，同比增长32.38％。养老保险增加结余49.83亿元，医疗保险增加结余15.2亿元，不过医疗保险支出只完成预算的37％。

　　市财政局在报告中进一步表示，今年要严格审核各项保险待遇，按时足额发放各项社保待遇，确保完成预算任务。同时加强社会保障政策研究，提高工作的前瞻性，重点改革社会医疗保险管理办法，优化和整合各项医疗保险管理办法，适当提高参保人员待遇水平。研究企业离休人员医疗费来源渠道，建立医疗保险为主、财政补贴为辅的医疗经费保障长效机制。下半年重点抓好少年儿童住院及大病门诊医疗管理办法的实施工作，做好基金收支管理，确保制度稳步推行，提高少儿医疗保障水平，切实减轻少儿家庭负担，真正落实市政府为民办实事举措。

　　另外，深圳市修订企业员工养老保险条例后，企业养老保险制度的可持续发展能力得到提高。2006年7月底，深圳市养老保险统筹基金历年累计赤字16.96亿元，新条例实施5个月后，截至12月底转变为累计结余2.13亿元。